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Pop in, pop out: CRISPR-Cas9을 이용한 새로운 유전자 타겟팅 전략

본 블로그 포스트에서는 Kühn과 Chu가 2015년 Genome Biology에 발표한 논문 "Pop in, pop out: a novel gene-targeting strategy for use with CRISPR-Cas9"를 리뷰합니다. 이 논문은 CRISPR-Cas9 시스템을 이용한 유전자 편집 기술의 정밀성과 효율성을 향상시키기 위한 새로운 2단계 전략인 'pop in & pop out' 방식을 제안하며, 특히 낮은 HDR 빈도로 인해 어려움을 겪는 경우에도 정확한 변이체를 획득할 수 있는 효과적인 대안을 제공합니다. 유전자 삽입 후 형광 마커를 삽입했다가 다시 제거할 수 있는 이 기술은 기존 CRISPR-Cas9 기반 유전자 타겟팅 기술의 한계를 극복하고, 실험 동물 모델 및 인간 세포주에서.. 카테고리 없음 2025. 4. 22.

The continuously evolving CRISPR barcoding toolbox - 논문 리뷰

본 리뷰 논문은 최근 발표된 두 가지 혁신적인 CRISPR 기반 세포 바코딩 기술을 중심으로, 발생생물학과 세포 추적 분야에서의 적용 가능성과 그 한계에 대해 다룬다. Gaj와 Perez-Pinera는 두 개의 주요 연구 결과를 소개하며, 각각의 기술이 어떻게 기존의 세포 계통 추적 방식보다 발전된 형태로 세포의 유전적 이력을 기록하고 해석할 수 있는지를 설명한다. Kalhor 등은 자기지시형 sgRNA(hgRNA)를 통해 세포 내에서 지속적으로 유전적 바코드를 생성하는 시스템을 마우스 모델에 적용하였고, Halperin 등은 진화형 CRISPR 플랫폼인 EvolvR을 통해 사용자가 정의한 염기 서열 범위 내에서 연속적이고 다양한 돌연변이를 유도할 수 있는 가능성을 입증하였다. 이 두 시스템은 세포 발생.. 카테고리 없음 2025. 4. 21.

효율적이고 특이적인 CRISPR-Cas9 유전체 편집 시스템: 대두 Phytoene Desaturase(PDS) 유전자 타겟팅 사례

이 블로그 글에서는 Lu와 Tian이 2022년 BMC Biotechnology에 발표한 논문 "An efficient and specific CRISPR-Cas9 genome editing system targeting soybean phytoene desaturase genes"를 중심으로, CRISPR-Cas9 기술을 이용한 대두 유전자 편집의 효율성과 특이성에 대한 최신 연구 결과를 다룬다. 본 연구는 PDS(phytoene desaturase) 유전자를 표적으로 하여 대두의 형질개량 가능성을 검토하였으며, 특히 'half-seed' explant를 활용한 Agrobacterium 중개형 유전자 전달 기술을 통해 높은 효율성과 유전성, 그리고 오프타겟 최소화를 실현했다. 실험은 대두 품종 Will.. 카테고리 없음 2025. 4. 20.

Unexpected consequences: exon skipping caused by CRISPR-generated mutations – 논문 리뷰

이번 리뷰에서는 Sharpe와 Cooper가 2017년 Genome Biology에 발표한 논문, “Unexpected consequences: exon skipping caused by CRISPR-generated mutations”를 다룬다. 이 논문은 CRISPR/Cas9 유전자 편집 기술이 의도하지 않은 결과로서 엑손 스킵핑(exon skipping)을 유발할 수 있으며, 이로 인해 전사체 및 단백질 수준에서 예기치 않은 표현형이 나타날 수 있음을 보여준다. 특히, 무기능(null) 대립유전자를 생성하려는 목적에도 불구하고 일부 경우에는 기능을 유지하거나 새로운 기능을 가진 단백질이 생성될 수 있어 연구 결과의 해석에 주의가 필요함을 강조한다. 본 리뷰에서는 해당 연구의 배경, 목적, 실험 방식.. 카테고리 없음 2025. 4. 19.

Comprehensive characterization of the neurogenic and neuroprotective action of a novel TrkB agonist using mouse and human stem cell models of Alzheimer’s disease - 새로운 TrkB 작용제 ENT-A011의 신경발생 및 신경보호 효과 분석

본 논문은 알츠하이머병(Alzheimer’s Disease, AD)에서의 신경발생 저하 문제를 해결하기 위해, 새로운 TrkB 수용체 작용제인 ENT-A011의 효능을 포괄적으로 분석한 연구입니다. 기존의 신경영양인자인 BDNF가 알츠하이머병의 병리학적 변화에 대해 긍정적인 영향을 미칠 수 있음에도 불구하고, 혈액-뇌 장벽을 통과하지 못하는 등의 한계로 인해 치료제로서의 활용은 어려웠습니다. 이에 대해 연구진은 ENT-A011이 BDNF의 신경발생 및 신경보호 기능을 모방하면서도 약리학적으로 더 우수한 특성을 가지는지를 마우스 및 인간 유래 줄기세포 기반 실험을 통해 입증하고자 하였습니다. 특히 ENT-A011이 TrkB 경로를 선택적으로 활성화하는지, 그리고 Aβ 독성으로부터 뉴런을 보호하는 기능을 수.. 카테고리 없음 2025. 4. 18.